为推进华能南通电厂三期“上大压小”1000mw级燃煤机组工程项目建设，华能国际电力股份有限公司和江苏国信资产管理集团有限公司按70%:30%股比组建了华能南通发电有限责任公司（以下简称“南通发电”）。公司于2008年11月24日完成工商注册登记，注册地为南通市天生港华能路。
2009年3月，华能南通发电有限责任公司与南通天生港发电有限公司签订了《合作协议书》，双方按50%:50%股比投资合作建设江苏南通发电有限公司（以下简称“苏通电厂） “上大压小”2×1000mw新建工程。新建项目于2011年底开工，两台机组分别于2014年1月10日、2月26日完成建设，投入商业运行。2014年项目投产以来两台百万机组运行稳定，节能环保技术指标均达到国内先进水平，2015年完成了#2机组的超低排放改造项目，切实履行环保和社会责任！
华能南通发电有限责任公司将继续秉承华能集团“三色公司的企业宗旨，本着对投资方负责、对企业负责、对员工负责的态度，实事求是、统筹兼顾，研究和推进企业管理模式完善化的方式方法，拓展新思路，不断理顺关系，全力运营好苏通电厂项目，为华能和地方经济持续健康发展增添动力。